Il pomodoro richiede elevate quantità di sostanze nutritive. Nei pomodori irrigati a goccia la crescita delle radici avviene principalmente entro i primi 20 cm. Il pomodoro è sensibile all'anossia, che influenza la nutrizione apportata, quindi una frequente irrigazione e un terreno strutturato di media leggerezza sono di fondamentale importanza. Il pomodoro è un ortaggio perenne-annuale, il che significa che può avere diversi cicli di raccolta, dall'allegagione alla calibratura e alla maturazione dei frutti, per cui la crescita vegetativa e generativa avvengono contemporaneamente dopo la prima allegagione. Questo è un aspetto importante, perché determina il modo in cui il pomodoro deve essere concimato. Ciò richiede un rapporto NPK equilibrato che massimizzi la produzione, ma non influisca sulla crescita continua. In caso di sovraddosaggio di potassio, i raccolti futuri potrebbero essere compromessi a causa di nuovi steli poveri e di una minore fioritura. Il calcio è un nutriente chiave, poiché la coltura del pomodoro è molto sensibile a un disturbo fisiologico legato al calcio, il B.E.R. (Blossom End Rot). I microelementi sono molto importanti in quanto la pianta è sottoposta a diversi cicli di raccolta e ad una crescita continua di nuovi germogli.